TP3 Architecture molécule ADN

TP3 Découverte de l’architecture moléculaire de l’ADN

Mise en situation et recherche à mener : On cherche à déterminer l’organisation de la molécule d’ADN .

Compétence :

• Utiliser un logiciel de modélisation moléculaire (Libmol…).

Après avoir utilisé le logiciel à votre disposition pour découvrir l’architecture moléculaire, schématiser la structure de la molécule d’ADN

Capacités

• Utilisation d’un logiciel
• Recenser, extraire, organiser et exploiter des informations

Atelier « Structure de l’ADN » :

Attention : le logiciel utilise des anciennes données scientifiques : la structure de l’#ADN serait maintenue par des interactions hydrophobes et non par des liaisons hydrogène comme on l’affirmait auparavant (source)

1. Afficher la molécule d’ADN

• Ouvrir le logiciel  LibMol (avec sa fiche technique)
• Ouvrir « ADN 14 paires de bases » dans LibMol (Fichiers/Rechercher dans la librairie de molécules)
• Afficher en « boules et bâtonnets », puis identifier les atomes impliqués dans la molécule d’ADN

2. Observer la molécule d’ADN

• Faire tourner la molécule en déplaçant la souris et en gardant le bouton gauche cliqué.
• Zoomer sur une partie de la molécule : bouton maj. du clavier + bouton gauche souris + déplacement vers le bas = zoom avant ; idem avec déplacement vers le haut= zoom arrière.

De combien de chaînes est constituée la molécule d’ADN ?

3. Les molécules constitutives de l’ADN

• Colorer les bases :  dans LibMol = Commandes/Colorer/Résidus
• Passer en représentation « Rubans » LibMol : Commandes/Représenter/Rubans ; Commandes/Colorer/Chaînes
• Faire apparaître les liaisons H

Repérer la disposition particulière des nucléotides et l’emplacement des liaisons hydrogènes.

Avec le matériel proposé (rubans bleu/rouge), modéliser la molécule d’ADN et repérer dessus les différents éléments identifiés sur LibMol/Rastop. Placer les sillons (grand/petit)

Schématiser l’ensemble d’une molécule d’ADN en utilisant les atomes distribuées.

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